Modelowanie molekularne i obliczeniowa biologia strukturalna - 2017z

Materiały przygotowujące do wejściówki z Linuxa

katalogi

vi

narzędzia systemowe

(plik do pracy dla tego skryptu to plik z ćwiczenia 2 ze skryptu vi)

sed

przeadresowanie

potoki

dostęp zdalny

Materiały przygotowujące do kartkówki z aminokwasów

Właściwości aminokwasów

Struktura aminokwasów

Materiały z wykładów

Wykład 1: Białka - na podstawie Molecular Conceptor'a - spis zagadnień

Slajdy uzupełniające do Molecular Conceptor'a

Materiały z ćwiczeń

Szablon do raportu I - analiza białek

Prezentacja struktury pliku PDB

Publikacje do raportu II

-publikacja 1

-publikacja 2

Procedura przygotowania układu do dynamiki molekularnej w pakiecie NAMD/VMD

Przygotowanie plików

Procedura analizy układu po dynamice molekularnej w pakiecie NAMD/VMD

Analiza energii

Skrypt do liczenia energii opisany w prezentacji (proszę zmienić txt na conf)

Szablon do raportu II - kompleks topoizomeraza I - SRSF6

Szablon do raportu III - dokowanie