Z BioFizInfo
(→Materiały z ćwiczeń) |
(→Materiały z ćwiczeń) |
||
(Nie pokazano 2 pośrednich wersji utworzonych przez tego samego użytkownika) | |||
Linia 37: | Linia 37: | ||
[[Media:lekIV.pdf | '''Wykład 8: Komputerowe wspomaganie projektowania leków - QSAR''']] | [[Media:lekIV.pdf | '''Wykład 8: Komputerowe wspomaganie projektowania leków - QSAR''']] | ||
+ | |||
+ | :Proponuję poczytać wykłady z Molecular Conceptor'a jest to dobre uzupełnienie do wykładów 6 -8 | ||
[[Media:lekV.pdf | '''Wykład 9: Farmakokinetyka''']] | [[Media:lekV.pdf | '''Wykład 9: Farmakokinetyka''']] | ||
Linia 55: | Linia 57: | ||
'''Procedura analizy układu po dynamice molekularnej w pakiecie NAMD/VMD''' | '''Procedura analizy układu po dynamice molekularnej w pakiecie NAMD/VMD''' | ||
:[[Media:Analiza energii.pdf | Analiza energii]] | :[[Media:Analiza energii.pdf | Analiza energii]] | ||
+ | :[[Media:energia.txt | Skrypt do liczenia energii opisany w prezentacji (proszę zmienić txt na conf)]] | ||
[[Media:raport2.pdf | '''Szablon do raportu II''' - kompleks topoizomeraza I - SRSF6 ]] | [[Media:raport2.pdf | '''Szablon do raportu II''' - kompleks topoizomeraza I - SRSF6 ]] | ||
[[Media:raport3.pdf | '''Szablon do raportu III''' - dokowanie]] | [[Media:raport3.pdf | '''Szablon do raportu III''' - dokowanie]] |
Aktualna wersja na dzień 15:26, 24 sty 2017
Materiały przygotowujące do wejściówki z Linuxa
- (plik do pracy dla tego skryptu to plik z ćwiczenia 2 ze skryptu vi)
Materiały z wykładów
Wykład 1: Białka - na podstawie Molecular Conceptor'a - spis zagadnień
Wykład 2: Modelowanie homologiczne
Wykład 3: Modelowanie białek ab initio / de novo
- Proponuję poczytać wykład pana Daniela E. Kahne dotyczący termodynamiki zwijania białek ze strony Life Sciences 1A [1]
- oraz publikację profesora Andrzeja Kolińskiego o modelach zredukowanych z 2007 roku [2]
Wykład 4: Mechanika i dynamika molekularna, dynamika Monte Carlo, dynamika Brownowska
Wykład 5: Lek od pomysłu do wdrożenia
Wykład 6: Lek - miejsce działania
Wykład 7: Komputerowe wspomaganie projektowania leków
Wykład 8: Komputerowe wspomaganie projektowania leków - QSAR
- Proponuję poczytać wykłady z Molecular Conceptor'a jest to dobre uzupełnienie do wykładów 6 -8
Materiały z ćwiczeń
Szablon do raportu I - analiza białek
Publikacje do raportu II
Procedura przygotowania układu do dynamiki molekularnej w pakiecie NAMD/VMD
Procedura analizy układu po dynamice molekularnej w pakiecie NAMD/VMD