Z BioFizInfo
| Linia 22: | Linia 22: | ||
* DOCK | * DOCK | ||
*FlexX | *FlexX | ||
| − | === | + | ===Przewidywanie struktury białka=== |
* CABS | * CABS | ||
* ROSETTA | * ROSETTA | ||
| − | |||
*MODELLER | *MODELLER | ||
Wersja z 17:06, 27 sty 2012
Spis treści
Modelowanie molekularne - oprogramowanie
Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.
Wizualizacja układów biologicznych
- VMD
- YASARA
- RasMol
- Molekel
Dynamika Molekularna
- AMBER
- NAMD
- GROMACS
- GROMOS
- YASARA
Ocena struktury przestrzennej białka
Uliniawianie sekwencji
- ClustalW
Budowa ligandów
- PRODRG
Dokowanie
- AUTODOCK4
- DOCK
- FlexX
Przewidywanie struktury białka
- CABS
- ROSETTA
- MODELLER