Z BioFizInfo
Skocz do: nawigacja, szukaj

Modelowanie molekularne - oprogramowanie

Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.

Wizualizacja układów biologicznych

  • VMD
  • YASARA
  • RasMol
  • Molekel

Dynamika Molekularna

  • AMBER
  • NAMD
  • GROMACS
  • GROMOS
  • YASARA

Ocena struktury przestrzennej białka

Uliniawianie sekwencji

  • ClustalW

Budowa ligandów

  • PRODRG

Dokowanie

  • AUTODOCK4
  • DOCK
  • FlexX

Zwijanie białek

  • CABS
  • ROSETTA

Budowa modeli białek

  • MODELLER
Źródło: „https://bioexploratorium.pl/mediawiki/index.php?title=Modelowanie_molekularne_-_oprogramowanie&oldid=784”