Z BioFizInfo
Skocz do: nawigacja, szukaj
Linia 11: Linia 11:
 
===Ocena struktury przestrzennej białka===
 
===Ocena struktury przestrzennej białka===
 
===Uliniawianie sekwencji===
 
===Uliniawianie sekwencji===
 +
*ClustalW
 
===Budowa ligandów===
 
===Budowa ligandów===
 
===Dokowanie===
 
===Dokowanie===

Wersja z 16:53, 27 sty 2012

Modelowanie molekularne - oprogramowanie

Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.

Wizualizacja układów biologicznych

  • VMD
  • YASARA

Dynamika Molekularna

  • NAMD
  • GROMACS
  • GROMOS
  • YASARA

Ocena struktury przestrzennej białka

Uliniawianie sekwencji

  • ClustalW

Budowa ligandów

Dokowanie

  • AUTODOCK4

Zwijanie białek

Budowa modeli białek