Z BioFizInfo
| Linia 1: | Linia 1: | ||
==Modelowanie molekularne - oprogramowanie== | ==Modelowanie molekularne - oprogramowanie== | ||
| − | '''Modelowanie molekularne''' – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości | + | '''Modelowanie molekularne''' – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji. |
===Wizualizacja układów biologicznych=== | ===Wizualizacja układów biologicznych=== | ||
| + | *VMD | ||
| + | *YASARA | ||
===Dynamika Molekularna=== | ===Dynamika Molekularna=== | ||
*NAMD | *NAMD | ||
| Linia 11: | Linia 13: | ||
===Budowa ligandów=== | ===Budowa ligandów=== | ||
===Dokowanie=== | ===Dokowanie=== | ||
| + | * AUTODOCK4 | ||
===Zwijanie białek=== | ===Zwijanie białek=== | ||
===Budowa modeli białek=== | ===Budowa modeli białek=== | ||
Wersja z 16:52, 27 sty 2012
Spis treści
Modelowanie molekularne - oprogramowanie
Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.
Wizualizacja układów biologicznych
- VMD
- YASARA
Dynamika Molekularna
- NAMD
- GROMACS
- GROMOS
- YASARA
Ocena struktury przestrzennej białka
Uliniawianie sekwencji
Budowa ligandów
Dokowanie
- AUTODOCK4