Z BioFizInfo
| Linia 7: | Linia 7: | ||
*Molekel | *Molekel | ||
===Dynamika Molekularna=== | ===Dynamika Molekularna=== | ||
| + | *AMBER | ||
*NAMD | *NAMD | ||
*GROMACS | *GROMACS | ||
Wersja z 17:03, 27 sty 2012
Spis treści
Modelowanie molekularne - oprogramowanie
Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.
Wizualizacja układów biologicznych
- VMD
- YASARA
- RasMol
- Molekel
Dynamika Molekularna
- AMBER
- NAMD
- GROMACS
- GROMOS
- YASARA
Ocena struktury przestrzennej białka
Uliniawianie sekwencji
- ClustalW
Budowa ligandów
- PRODRG
Dokowanie
- AUTODOCK4
- DOCK
- FlexX
Zwijanie białek
- CABS
Budowa modeli białek
- MODELLER