Z BioFizInfo
(Utworzył nową stronę „'''Model HP''' (hydrophobic-polar protein folding model) to model białka (lub dowolnego polimeru o podobnych własnościach) wykorzystywany do badania ogólnych zasad …”) |
|||
| Linia 1: | Linia 1: | ||
'''Model HP''' (hydrophobic-polar protein folding model) to model białka (lub dowolnego polimeru o podobnych własnościach) wykorzystywany do badania ogólnych zasad rządzących procesami zwijania białek. Badania tego typu w przypadku modeli pełnoatomowych wiążą się ze znacznymi kosztami obliczeniowymi. Model HP, ze względu na uproszczaoną charakterystykę, umożliwia przeprowadzenie krótkiej symulacji (trwającej od kilku minut do kilku godzin), w trakcie której układ osiąga wszystkie możliwe mikrostany. | '''Model HP''' (hydrophobic-polar protein folding model) to model białka (lub dowolnego polimeru o podobnych własnościach) wykorzystywany do badania ogólnych zasad rządzących procesami zwijania białek. Badania tego typu w przypadku modeli pełnoatomowych wiążą się ze znacznymi kosztami obliczeniowymi. Model HP, ze względu na uproszczaoną charakterystykę, umożliwia przeprowadzenie krótkiej symulacji (trwającej od kilku minut do kilku godzin), w trakcie której układ osiąga wszystkie możliwe mikrostany. | ||
| + | |||
| + | Idea modelu HP opiera się na obserwacji, iż kluczową rolę w procesie zwijania białka pełni efekt hydrofobowy (spotkać się można również z terminem: "oddziaływania hydrofobowe"). | ||
Wersja z 19:32, 10 lut 2011
Model HP (hydrophobic-polar protein folding model) to model białka (lub dowolnego polimeru o podobnych własnościach) wykorzystywany do badania ogólnych zasad rządzących procesami zwijania białek. Badania tego typu w przypadku modeli pełnoatomowych wiążą się ze znacznymi kosztami obliczeniowymi. Model HP, ze względu na uproszczaoną charakterystykę, umożliwia przeprowadzenie krótkiej symulacji (trwającej od kilku minut do kilku godzin), w trakcie której układ osiąga wszystkie możliwe mikrostany.
Idea modelu HP opiera się na obserwacji, iż kluczową rolę w procesie zwijania białka pełni efekt hydrofobowy (spotkać się można również z terminem: "oddziaływania hydrofobowe").