Modelowanie molekularne - oprogramowanie: Różnice pomiędzy wersjami

Z BioFizInfo
Przejdź do nawigacji Przejdź do wyszukiwania
Mkolin (dyskusja | edycje)
Nie podano opisu zmian
Mkolin (dyskusja | edycje)
Nie podano opisu zmian
Linia 16: Linia 16:
* AUTODOCK4
* AUTODOCK4
===Zwijanie białek===
===Zwijanie białek===
* CABS
===Budowa modeli białek===
===Budowa modeli białek===

Wersja z 27 sty 2012, 16:54

Modelowanie molekularne - oprogramowanie

Modelowanie molekularne – zbiór technik obliczeniowych, które służą do modelowania i przewidywania właściwości cząsteczek lub układów ponadcząsteczkowych. Poniżej lista programów znajdujących zastosowanie w modelowaniu układów biologicznych, ich badaniu i wizualizacji.

Wizualizacja układów biologicznych

  • VMD
  • YASARA

Dynamika Molekularna

  • NAMD
  • GROMACS
  • GROMOS
  • YASARA

Ocena struktury przestrzennej białka

Uliniawianie sekwencji

  • ClustalW

Budowa ligandów

Dokowanie

  • AUTODOCK4

Zwijanie białek

  • CABS

Budowa modeli białek